格列卫主要治疗慢性髓性白血病和胃肠道间质瘤，至于效果如何，因个人病情和体制而异，所以在使用前要得到医生的确诊，切不可盲目用药。而且众所周知，“是药三分毒”很多药物多多少少服用后都会有副作用，格列卫当然也是如此。
首先，服用格列卫可能会产生的副作用有骨髓抑制、胃肠道反应(轻微时恶心、呕吐、腹泻)、肌肉骨骼毒性、肝脏毒性(不常见)、水肿(轻微时如眶周。严重时如肺水肿，胸膜/心包积液、腹水)、皮疹、瘙痒。
格列卫的这些副作用都是比较轻微的，一般都是五个月到半年，所有副作用都会消退，但是这个还是需要看具体情况，患者的体质对副作用也会有所影响。要是出现严重副作用的话，最好的是停药，在医生的知道下停药，在服用其他药物控制病情。
另外正确的服用格列卫可以帮助患者减轻格列卫的副作用：
通常成人每日一次，每次400㎎或600㎎，以及日服用量800㎎即400㎎剂量每天2次。另外儿童和青少年每日一次或分两次服用格列卫。不能吞咽药片的患者(包括儿童)，可以将格列卫分散于不含气体的水或苹果汁中(100㎎片约用50ml，400㎎约用200ml)。应搅拌混悬液，一旦药片崩解完全应立即服用。
而且患者在佛营格列卫治疗期间第一个月宜每周查一次全血象，第二个月每两周查一次，以后则视需要而定(如每2-3个月查一次)。若发生严重中性粒细胞或血小板减少，应调整剂量。